La genómica es fundamental para la investigación biológica y biomédica contemporánea. Sin embargo, la formación en dicha área no está suficientemente disponible en el posgrado. En ese sentido, la idea de este curso es proveer las bases teórico-prácticas en cuestiones de genómica comparativa, metagenómica y transcriptómica.

1. Presentación del curso y plática introductoria (Santiago, CCG)
2. Unix y servidores (Gabriela/Alfredo, CCG)
Comandos básicos
Tuberías y redireccionamientos
Transferencia de Archivos
3. Ensamble y Anotación Funcional de genomas (Luis, CCG)
Análisis de Calidad y limpieza
Ensambladores
Estadísticas de calidad de ensambles
Anotación funcional
4. Metagenómica Shotgun (Luis, CCG)
Análisis de calidad y limpieza
Ensamble metagenómico
Clasificación taxonómica
Visualización
5. Ensamble Transcriptómico de novo Trinity (Mishael, CCG)
Análisis de calidad y limpieza
Ensamble de novo
Expresión diferencial
Anotación funcional
6. Análisis Transcriptómico Genoma de referencia Trinity (Mishael, CCG)
Análisis de calidad y limpieza
Alineamiento
Expresión diferencial
Anotación funcional
7. Homología y Pangenómica (Gabriela/Luis, CCG)
Alineamiento local
Alineamiento global
Filogenómica

7. Evaluación (Santiago, CCG)
Examen y presentación de proyectos

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