De acuerdo con predicciones de la Organización Mundial de la Salud para el año 2050 la aparición de cepas multidrogorresistentes (MDR) provocaran el deceso de 10 millones de muertes humanas anualmente. La generación y propagación de microorganismos MDR se debe principalmente al uso indiscriminado de antibióticos en la medicina humana, animal y agroquímicos, el desarrollo de nuevas opciones terapéuticas, regulaciones gubernamentales deficientes en cuanto a la venta libre de antibióticos y a las malas prácticas para el desecho de antibióticos no metabolizados al sistema de alcantarillado. Aunado a lo anterior, surge la necesidad de buscar nuevas alternativas para el tratamiento de enfermedades provocadas por esta clase de microorganismos.
Los péptidos antimicrobianos (AMPs) son pequeñas biomoléculas catiónicas o aniónicas anfipáticas que protegen a su huésped de un amplio espectro microorganismos; por lo regular están compuestos de 5-50 residuos de aminoácidos. Múltiples trabajos han reportado que los AMPs pueden inhibir el desarrollo de microorganismos MDR como Helicobacter pylori (resistente a claritromicina), Pseudomonas aeruginosa (resistente a carbapenem), etc., debido a su potente actividad antimicrobiana y diversos mecanismos de acción, por lo cual son una alternativa para el tratamiento de cepas MDR.
En este contexto, el curso tiene el propósito de introducir al estudiante al mundo de los AMPs y su importancia para el control de microorganismos MDR. En el curso se abordarán temas como la identificación, diseño, producción, purificación y función de los AMPs.

Las clases están programas para los miércoles y/o jueves de 10 a 13 h.
1. Introducción al curso (Gabriel Del Rio Guerra; 1 sesión Miércoles 13 de agosto,2025)
1.1 Historia, conceptos fundamentales y desarrollo de los AMPs (Gabriel Marcelino Pérez; 2 sesión Jueves 14 de agosto, 2025)
1.2. Importancia biológica, clasificación y modo de acción de los AMPs (Gabriel Marcelino Pérez; 3 sesión Miércoles 20 de agosto, 2025)
1.3 Asignación de problemas a abordar en la sección 2 (Gabriel Del Río; 4 sesión Jueves 21 de agosto, 2025)
2. Diseño de AMPs
2.1. Introducción al aprendizje de máquina: Shallow learning (Gabriel Del Río; 5 sesión Miércoles 27 de agosto, 2025)
2.1.1 Práctica usando Weka (Gabriel Del Río; 6 sesión Jueves 28 de agosto 2025)
2.2. Introducción al aprendizaje de máquina deep learning (Carlos A. Brizuela; 7 sesión Miércoles 3 de septiembre, 2025)
2.2.1 Práctica de deep learning (Carlos A. Brizeula; 8 sesión Miércoles 10 de septiembre, 2025)
2.4. Identificación y diseño computacional de AMPs (Carlos Alberto Brizuela Rodríguez; 9 y 10 sesión Miércoles 17 y miércoles 24 de septiembre, 2025)
2.3 Presentaciones de alumnos (11 y 12 sesión Miércoles 1 y jueves 2 de octubre 2025)
4.1 Polifarmacología (Gabriel Del Rio Guerra; 13 sesión Miércoles 8 de octubre, 2025)
4.2 CPP, Autofagia, Unión a ADN por AMPs (Gabriel Del Río; 14 sesión Jueves 9 de octubre, 2025)
5. Presentaciones de alumnos (15 y 16 sesión Miércoles 15 y jueves 16 de octubre, 2025)
6.-Aislamiento de AMPs
6.2. Potencial comercial de los AMPs (Gabriel Del Río; 17 sesión Miércoles 22 de octubre 2025)
7. Técnicas de purificación y caracterización de AMPs
7.1. Técnicas de purificación (Gabriel Marcelino Pérez; 18 sesión Jueves 23 de octubre de 2025)
7.1.1. Cromatografía líquida de proteínas a alta velocidad (FPLC)
7.1.2. Cromatografía líquida de alta resolución (HPLC)
7.1.3 Extracción en fase sólida en columna
7.1.4. Filtración por membrana
7.2. Técnicas de caracterización (Gabriel Marcelino Pérez; 19 sesión Miércoles 29 de octubre de 2025)
7.2.1 Secuenciación
7.2.2. Electroforesis en gel de agarosa
7.3.3. Espectrometría de masas
8. Evaluación de la actividad antimicrobiana de los AMPs
8.1. Actividad bactericida, bacteriostática, fungicida y fungistática (Gabriel Marcelino Pérez; 20 sesión Jueves 30 de octubre, 2025)
8.2. Conceptualización de vida y muerte celular (Gabriel Del Río; 21 sesión Miércoles 5 de noviembre, 2025)
8.3 Muerte en organismos procariontes y eucariontes (Gabriel Del Río; 22 sesión Miércoles 12 de noviembre, 2025)
8.4 Examen (23 sesión Miércoles 19 de noviembre, 2025)

Bibliografía
Ajesh, K. and Sreejith, K. (2023) Antimicrobial Peptides. Elsevier. doi: 10.1016/C2020-0-01910-9.
Allen, J. L., Kennedy, S. J. and Shaw, L. N. (2022) Colorimetric assays for the rapid and high-throughput screening of antimicrobial peptide activity against diverse bacterial pathogens. 1st edn, Methods in Enzymology. 1st edn. Elsevier Inc. doi: 10.1016/bs.mie.2021.10.008.
Sanjeevamuthu, S. et al. (2019) Antimicrobial peptides, in Biocidal Polymers. De Gruyter, pp. 263–294. doi: 10.1515/9783110639131-012.
Walls, D. and Loughran, S. (2017) Protein Chromatography, Methods in Molecular Biology. Edited by Dermot Walls and S. T. Loughran. New York, NY: Springer New York (Methods in Molecular Biology). doi: 10.1007/978-1-4939-6412-3.
Wang, G. (2022) Unifying the classification of antimicrobial peptides in the antimicrobial peptide database. 1st edn, Methods in Enzymology. 1st edn. Elsevier Inc. doi: 10.1016/bs.mie.2021.09.006.
Bases de datos
-PDB: https://www.rcsb.org/
-Uniprot: https://www.uniprot.org/
-CAMPR3: http://www.camp3.bicnirrh.res.in/
-DBAASP: http://csb.cse.yzu.edu.tw/dbAMP/
Freeware
Weka: https://ml.cms.waikato.ac.nz/weka

El curso será teórico-práctico